طبقه بندی ژنتیکی گندمهای ایران با استفاده از الکتروفورز پروتئینها (sds-page) ‘لیزر اسکانر دنسیتومتری (lsd) وتجزیه ای خوشه ای

نویسندگان

علی مسعودی نژاد

بهمن یزدی صمدی

سیروس عبد میشانی

محمد نبی سربلوکی

چکیده

الگوی پروتئینهای تفکیک شده بر روی ژل منعکس کننده ژنوم ارقام بوده ولذا می تواند به عنوان یک صفت و روش جهت طبقه بندی و شناسایی ارقام استفاده شود. در این مطالعه تعدادی از گندمهای ایران انتخاب و پس از انجام الکتوفورز (sds-pade) برای پروتئین ذخیرهای آندوسپرم (گلوتنین) ‘ از پروفیل مربوط به کلیه باندهای هر نمونه (w-gliadin,hmw-gluteninوlme-glutenin) با استفاده از دستگاه لیزر اسکاتر منحنی هایی بدست آمد. جهت طبقه بندی از روش آماری تجزیه خوشه ای استفاده شد. صفات مورد مطالعه‘ ژنوتیپ ا زنقطه نظر آللهای hmw-gs و سطوح زیرمنحنی ناحیه های مختلف پروفیل الکتروفورزی بودند . درصد تشابه با استفاده از ضرایب همبستگی پیرسون ‘ کانیرا‘ وینستین و فاصله اقلیدسی محاسبه گردید. بر اساس ماتریس تشابه یا فاصله ‘ دندروگرام رسم گردید و ژنوتیپهای گروهبندی شدند. برای مکانهای ژنی کنترل کننده hmw-glutenin از روشهای مختلف تجزیه خوشه ای (upgma,sl.cl.wpgma)استفاده شد. که مناسبترین نتایج با روش upgma بدست آمد.

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

طبقه بندی ژنتیکی گندمهای ایران با استفاده از الکتروفورز پروتئینها (SDS-PAGE) ‘لیزر اسکانر دنسیتومتری (LSD) وتجزیه ای خوشه ای

الگوی پروتئینهای تفکیک شده بر روی ژل منعکس کننده ژنوم ارقام بوده ولذا می تواند به عنوان یک صفت و روش جهت طبقه بندی و شناسایی ارقام استفاده شود. در این مطالعه تعدادی از گندمهای ایران انتخاب و پس از انجام الکتوفورز (SDS-PADE) برای پروتئین ذخیرهای آندوسپرم (گلوتنین) ‘ از پروفیل مربوط به کلیه باندهای هر نمونه (w-Gliadin,HMW-GluteninوLME-Glutenin) با استفاده از دستگاه لیزر اسکاتر منحنی هایی بدست آمد...

متن کامل

شناسایی ‘ طبقه بندی و بررسی ارزش نانوایی گندمهای ایران با استفاده از الکتروفورز پروتئینهای ذخیره ای اندوسپرم(گلوتنین)

رابطه بین آللهای زیر واحدهای گلوتنین با وزن مولکولی بالا (HMW-GS) و ارزش نانوایی در 81 رقم از گندمهای ایرانی و خارجی با استفاده از روش SDS-PAGE مورد مطالعه قرار گرفت. درمکان ژنی GLU-A1 زیر واحدهای 1و*2 که آللهای خوبی برای کیفیت هستند در 31 درصد ارقام دیده شدند. درمکان ژنی GLU-D1 زیر واحدهای 10+5 که آللهای بسیار مطلوبی برای کیفیت و ارزش نانوایی هستند و زیر واحدهای 12+4 ‘ 12+3 و 12+2 که در مقایسه...

متن کامل

شناسایی و طبقه بندی گندمهای ایران با استفاده از الکتروفورز گلیادین

گلیادین یکی از پروتئینهای ذخیره ای اندوسپرم گندم می باشد. که دارای پلی مورفیسم فراوان است و توسط گروهی از ژنها که بر روی بازوهای کوتاه کروموزومهای همولوگ گروه یک وشش قرار دارندکنترل می شود. در این آزمایش حدود 50 رقم از گندمهای ایرانی وخارجی انتخاب شدند . از روش الکتروفورز A-PAGE بر اساس روش لافیاندرا استفاده شد. واریته مارکوئیس بعنوان واریته استاندارد بود. چند شکلی زیادی بویژه در ناحیه امگا وگا...

متن کامل

شناسایی ‘ طبقه بندی و بررسی ارزش نانوایی گندمهای ایران با استفاده از الکتروفورز پروتئینهای ذخیره ای اندوسپرم(گلوتنین)

رابطه بین آللهای زیر واحدهای گلوتنین با وزن مولکولی بالا (hmw-gs) و ارزش نانوایی در 81 رقم از گندمهای ایرانی و خارجی با استفاده از روش sds-page مورد مطالعه قرار گرفت. درمکان ژنی glu-a1 زیر واحدهای 1و*2 که آللهای خوبی برای کیفیت هستند در 31 درصد ارقام دیده شدند. درمکان ژنی glu-d1 زیر واحدهای 10+5 که آللهای بسیار مطلوبی برای کیفیت و ارزش نانوایی هستند و زیر واحدهای 12+4 ‘ 12+3 و 12+2 که در مقایسه...

متن کامل

شناسایی و طبقه بندی گندمهای ایران با استفاده از الکتروفورز گلیادین

گلیادین یکی از پروتئینهای ذخیره ای اندوسپرم گندم می باشد. که دارای پلی مورفیسم فراوان است و توسط گروهی از ژنها که بر روی بازوهای کوتاه کروموزومهای همولوگ گروه یک وشش قرار دارندکنترل می شود. در این آزمایش حدود 50 رقم از گندمهای ایرانی وخارجی انتخاب شدند . از روش الکتروفورز a-page بر اساس روش لافیاندرا استفاده شد. واریته مارکوئیس بعنوان واریته استاندارد بود. چند شکلی زیادی بویژه در ناحیه امگا وگا...

متن کامل

مقایسه گروه بندی ارقام برنج با استفاده از داده‌های الکتروفورز SDS-PAGE پروتئین‌های ذخیره‌ای دانه و داده‌های صفات کمّی

شناخت کافی از تنوع ژنتیکی و طبقه بندی ژرم پلاسم ها جهت انتخاب والدین مناسب برای اهداف به نژادی لازم و ضروری است. در این تحقیق از الگوی الکتروفورز پروتئینهای ذخیره ای ارقام برنج و داده های حاصل از اندازه گیری صفات کمّی برای بررسی تنوع ژنتیکی و طبقه بندی مجموعه ای از برنجهای ایرانی و خارجی استفاده شد. بدین منظور تعداد 49 رقم برنج ایرانی و خارجی از موسسه تحقیقات برنج کشور تهیه و در مزرعه آموزشی آمو...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید


عنوان ژورنال:
مجله علوم کشاورزی ایران

ناشر: پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران

ISSN

دوره 1

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023